1964年6月5日、ホメイニは逮捕され、亡命しました。彼はイラク、トルコ、そしてフランスに追放された。ホメイニーは、イランの最後のシャーであるモハンマド・レザ・パフラビに対してフランスで多くの演説をしました。 1979年1月16日、パフラヴィー朝はイランを去りました。 2週間後の2月1日、ホメイニーはイランに戻りました。
彼はコム（イランの都市）で伝統的な宗教教育を受けました。彼がナジャフ（イラクの聖地）に数年間住んでいたとき、彼は政府についてのイスラム教の考えについて話しました。その間、彼はvelayat-e faqih（「法学者の政府」）の理論を洗練させました。
1979年2月11日、ホメイニーは彼の最初の首相であるメフディーバザルガンを任命しました。 1979年3月30日、イランで国民投票が行われ、その結果、君主制はイスラム共和制に置き換えられました。イスラム革命後、ホメイニーはイランの最高指導者になりました。
Rushdie fatwaEdit
1989年初頭、ホメイニーはイスラム教徒にサルマンラシュディと「出版に関与したすべての人々を殺すように求めるファトワー」を発行しました。 “悪魔の詩と呼ばれる彼の本の。ラシュディが殺されたことは一度もない。しかし、この本の日本人翻訳者は1991年に刺殺されました。