Unaggiunta chiave degli Atti includeva la creazione di cinque distretti militari nel sud, ciascuno comandato da un generale, che avrebbe servito come governo sostituto per la regione. Inoltre, il Congresso richiedeva che ogni stato redigesse una nuova costituzione statale, che avrebbe dovuto essere approvata dal Congresso. Gli stati dovevano anche ratificare il quattordicesimo emendamento alla costituzione degli Stati Uniti e concedere il diritto di voto agli uomini neri. I veti del presidente Andrew Johnson a queste misure furono annullati dal Congresso.
Il generale George Meade (del terzo distretto militare) nominò il generale di brigata Thomas H. Rugerto in sostituzione del governatore della Georgia Charles J. Jenkins, che aveva è stato eletto come unico candidato nel 1865 a succedere a James Johnson, che era stato nominato dal presidente Andrew Johnson.
Dopo che Ex parte McCardle (1869) si presentò alla Corte Suprema degli Stati Uniti, il Congresso temette che la Corte potesse dichiarare incostituzionali gli Atti di ricostruzione. Per evitare ciò, il Congresso ha abrogato lHabeas Corpus Act 1867, eliminando la giurisdizione della Corte Suprema sul caso.