Spansk regel (1539–1898) Rediger
El Morro
På råd fra Gonzalo Fernández de Oviedo y Valdés blev der bygget et batteri på det klippefyldte forbjerg kaldet “Morro”, da La Fortalezas placering blev anset for uegnet. Dette batteri bestod af et tårn med 4 omfavnelser og et vandbatteri ved foden af skråningen til 3 kanoner. I 1555 havde Morro 8 bronzekanoner som forsvar mod franske kapere.
Under den spanske regering på øen overlevede El Morro, også kendt som Castillo de San Felipe, flere angreb fra udenlandske magter på forskellige lejligheder.
I 1593 sammensatte portugisiske soldater, sendt fra Lissabon på ordre fra Phillip II, den første garnison fra San Felipe del Morro-fæstningen i Puerto Rico. Nogle bragte deres hustruer, mens andre giftede sig med puertoricanske kvinder, og i dag er der mange puertoricanske familier med portugisiske efternavne.
I 1595 angreb englænderen Sir Francis Drake uden held San Juan med sin flåde i slaget ved San Juan (1595).
I 1598 angreb englænderne igen, ledet af George Clifford, 3. jarl af Cumberland. Clifford lykkedes, fordi han angreb San Juan over land i stedet for at forsøge at komme ind gennem San Juan Bay. Imidlertid tvang en epidemi af dysenteri ham til at flygte fra øen efter slaget ved San Juan (1598).
I 1625 angreb hollænderne, ledet af Boudewijn Hendricksz, også øen, der efterlignede George Cliffords overland. Til borgernes forbløffelse var angriberne i stand til at passere foran slottets forsvarere og ind i havnen uden for byens kanoner. El Morro formåede at modstå belejringen og fik til sidst hollænderne til trække sig tilbage, selvom angriberne var i stand til at plyndre og brænde byen, inden de forlod slaget ved San Juan (1625).
I 1797 tog den britiske general Ralph Abercromby og admiral Henry Harvey med en styrke på 7.000–13.000 mænd, invaderede øen Puerto Rico. Kaptajn general Don Ramón de Castro og hans styrker frastødte angrebet. Abercromby og Harvey blev besejret i slaget ved San Juan (1797).
El Morros sidste aktive kamp opstod under en flådebombardement af den amerikanske flåde under den spansk-amerikanske krig i 1898, der sluttede a ge af flådekrig i Caribien, i det mindste i klassisk forstand. Under den spansk-amerikanske krig blev slottet angrebet mindst tre gange af amerikanske flådestyrker, hvoraf den største var bombardementet i San Juan den 12. maj 1898. Krigen sluttede med underskrivelsen af Paris-traktaten, hvor Spanien afstod ejerskab af øerne Puerto Rico, Cuba, Guam og Filippinerne til De Forenede Stater.
Amerikansk militær besættelse (1898–1961) Rediger
Ændring af det spanske befæstning af amerikansk militær under 2. verdenskrig
El Morro og mange andre spanske regeringsbygninger i det gamle San Juan blev en del af en stor post fra den amerikanske hær, kaldet Fort Brooke. I begyndelsen af det 20. århundrede fyldte det amerikanske militær esplanaden (det grønne område foran “El Morro”) med baseball-diamanter, hospitaler, officerer “kvartaler, en officer” klub og endda en golfbane.
Den 21. marts 1915 var løjtnant Teófilo Marxuach dagens officer på El Morro-fæstningen. Odenwald (bygget i 1903 og ikke at forveksle med det tyske krigsskib af 2. verdenskrig med samme navn) var et bevæbnet tysk forsyningsskib, der forsøgte at tvinge sig ud af bugten og levere forsyninger til de tyske ubåde, der ventede i Atlanterhavet. Ocean. Løjtnant Marxuach gav ordre om at åbne ild mod skibet, som blev tvunget til at vende tilbage; dens forsyninger blev konfiskeret. De skud, der blev bestilt af løjtnant Marxuach, anses bredt for at være de første skud, der blev affyret af USA i Første Verdenskrig, skønt det første egentlige krigsskud, der blev affyret af USA, kom den dag, krigen blev erklæret, under skiften af SMS Cormoran ud for Guam.
Under Anden Verdenskrig tilføjede den amerikanske hær en massiv betonbunker til toppen af El Morro for at tjene som en havneforsvars brandstation for at lede et netværk af kystartilleri-steder og for at beholde hold øje med tyske ubåde, der hærgede skibsfarten i Caribien. Et fyrtårn, genopbygget af den amerikanske hær i 1906–08, er det højeste punkt på El Morro, der står 55 m over havets overflade. Flagstænger på El Morro i dag sædvanligvis flyver USAs flag, det Puerto Ricanske flag og korset af Burgundy-flag, også kendt på spansk som las Aspas de Borgoña, en standard, der blev meget brugt af spanske hære rundt om i verden fra 1506 til 1785.
Nationalpark (1961 – nu) Rediger
Panoramaudsigt over byen fra slottet
I 1961 trak den amerikanske hær officielt pension fra El Morro. Fortet blev en del af National Park Service, der skulle bevares som museer.I 1983 blev Castillo og bymuren erklæret verdensarv af FN. Til ære for femtårsdagen for Columbus-sejladsen i 1992 blev den udvendige esplanade ryddet af palmer, der var plantet af den amerikanske hær i Fort Brooke-æraen, og gendannede det “åbne felt” for El til det åbne udseende. Morros kanon ville have haft i den koloniale spanske tid. Parkeringspladser og asfalterede veje blev også fjernet, og El Morro fyr repareret og gendannet til sit oprindelige udseende. El Morro blev brugt som et filmsæt i 1996-filmen Amistad. Steven Spielberg brugte det til at repræsentere et fort i Sierra Leone, hvor afrikanske slaver blev auktioneret i 1839. Afrikansk slavearbejde blev brugt ud over lokalt arbejde for at hjælpe med at bygge castillo. El Morro var en defensiv militær befæstning og en vigtig del af San Juan “s havneforsvarssystem. Puerto Rico som sådan blev af den spanske krone betragtet som “nøglen til Antillerne”; intet fjendeskib kunne navigere i dets farvande uden frygt for fangst.
Der afholdes en årlig håndværkerfestival i fortet hver juli.