NapsterEdit
Den 1 juni 1999 släppte Fanning ett preliminärt beta-program av Napster och snart handlade hundratals högskolestudenter på Northeastern musik. Sean Parker var medgrundare.
SnocapEdit
År 2002 utnämndes Fanning till MIT Technology Review TR100 som en av de 100 bästa innovatörerna i världen under 35 år 2003 öppnade han ett nytt företag, Snocap, tillsammans med Jordan Mendelson (Napsters chefarkitekt) och Ron Conway. Företaget strävade efter att vara en legitim marknadsplats för digitala medier. Men deras partners och allmänheten svarade inte. Bra kundsupport var dåligt och tekniska problem var många. En av deras primära partners, CD Baby, skrev en skarp redogörelse för deras relation. I slutet av 2007 avskedade Snocap 60% av sin personal. ValleyWag skrev en artikel som Fanning hade länge lämnade Snocap och började arbeta med ett annat företag, Rupture. ValleyWag-artikeln uppgav att misslyckandet till stor del berodde på Snocaps VD Rusty Rueff och den tidigare VP Engineering Dave Rowley, som ”gjorde en röra av teknik innan han fick sparken ”. Snocap ville snabbt sälja sig själv. 2008 hittade de en köpare; imeem förvärvade Snocap i en brandförsäljning.
RuptureEdit
Rupture-projektet tillkännagavs 2007 med såddfinansiering, och CrunchBase noterar att Shawn officiellt blev VD för Rupture var 2 oktober 2007 .
I december 2006 utvecklade Fanning tillsammans med grundaren Jon Baudanza Rupture, ett socialt nätverksverktyg som är utformat för att hantera uppgiften att publicera spelarnas individuella profiler till ett gemensamt utrymme och underlätta kommunikation mellan World of Warcraft-spelare. Rupture förvärvades senare av Electronic Arts för $ 30 miljoner. Fannings karriär på Electronic Arts var kortvarig eftersom en uppsägning i november 2009 inkluderade honom och hans team vid Rupture.
PathEdit
Några månader efter att Fanning avskedades från Electronic Arts startade han ett nytt företag som heter Path.com. I januari 2010 meddelade Dave Morin att han lämnade Facebook, där han var Senior Platform Manager, för att gå med i Fanning och bli VD på Path.
AirtimeEdit
2011 återförenades Fanning med Napster grundare Sean Parker grundade Airtime.com. Några av investerarna är Ron Conway, Michael Arrington och Ashton Kutcher. Fanning fungerar som VD och Parker som verkställande ordförande.
Airtime lanserades i juni 2012 vid ett katastrofalt offentligt evenemang där Parker och Fanning betalade enorma summor för att ha kändisar närvarande men produkten upprepade gånger kraschade och slutligen misslyckades med att fungera . Greg Sandoval från CNET kommenterade: ”För att starta sin nya start bör Sean Parker ha spenderat mindre av sina miljarder på kändisgäster och mer av det på att fixa sin teknik.”
Helium SystemsEdit
2013 grundade Fanning Helium Systems tillsammans med Amir Haleem och Sean Carey. I december 2014 meddelade företaget att det samlade in 16 miljoner dollar i finansiering under ledning av Khosla Ventures med deltagande av bland andra FirstMark Capital, Digital Garage, Marc Benioff, SV Angel och Slow Ventures.