Yemen WarEdit
1962 blev Egypten inblandad i inbördeskriget i Jemen, stödja Abdullah al-Sallals revolutionära regim som hade avskedat landets tidigare härskare, Imam Badr, och förklarat en republik. Detta visade sig vara en betydande ekonomisk och militär börda för Egypten och skapade antipati mot Saudiarabien, vilket stödde de jemenitiska lojalisterna.
1967 WarEdit
Under arabiskt tryck och som ett resultat av ökande folkliga förväntningar på arabisk militär den 18 maj 1967 ber Nasser FN: s generalsekreterare U Thant att dra tillbaka FN: s nödstyrka (UNEF) som är stationerad på Egyptens sida av gränsen till Israel i Sinai. Egypten stängde Tirans sund för israelisk sjöfart som vedergällning för Israels avledning av floden Jordanien. Kung Hussein av Jordanien besökte Kairo den 30 maj och undertecknade en jordansk-egyptisk försvarspakt.
Den 5 juni kl. Israels arméstyrkor slog ett krossande slag mot Egypten. Sjutton egyptiska flygfält attackerades och större delen av det egyptiska flygvapnet förstördes på marken som ledde till den israeliska ockupationen av Sinaihalvön. Jordanien gick in i kriget på Egypts sida men tvingades att acceptera FN: s säkerhetsråds eldupphör den 7 juni efter att Israel ockuperade de jordanskontrollerade territorierna på Västbanken och den egyptisk kontrollerade Gazaremsan. Egypten accepterade också eldupphöret. Israeliska trupper attackerade de strategiska militära installationerna i de syriska Golanhöjderna och ockuperade staden Quneitra. Syrien accepterade eldupphöret den 10 juni.
Egyptens nederlag under kriget 1967 tvingade Nasser att avgå den 9 juni och utsåg vice president Zakaria Mohieddin till sin efterträdare. Han gav emellertid upp efter massiva populära demonstrationer av sju högt uppsatta officerare prövades i kölvattnet av nederlaget, inklusive krigsminister Shams Badran. Överbefälhavaren för de väpnade styrkorna Fältmarskalk Abdel-Hakim Amer arresterades och rapporteras ha begått självmord medan han var i vårdnad i augusti.