Context: Deși se știe că mutațiile promotorului cauzează consecințe importante din punct de vedere funcțional pentru expresia genelor, analiza promotorului nu este o regulă parte a diagnosticului ADN.
Conținut: această revizuire acoperă diferite aspecte importante ale analizei mutației promotorului și include o procedură model propusă pentru studierea mutațiilor promotorului. Caracterizarea unei variații a secvenței promotor include un studiu cuprinzător al literaturii și bazelor de date despre mutații umane și factori de transcripție. Amprenta filogenetică este, de asemenea, utilizată pentru a evalua importanța presupusă a regiunii de interes a promotorului. Această analiză in silico este, în general, urmată de teste funcționale in vitro, dintre care testele de transfecție tranzitorii și stabile sunt considerate metodele standard de aur. Testele de deplasare și supershift ale mobilității electroforetice sunt utilizate pentru a identifica proteinele cu acțiune trans care interacționează putativ cu regiunea de interes a promotorului. În cele din urmă, testele de imunoprecipitare a cromatinei sunt esențiale pentru a confirma legarea in vivo a acestor proteine la promotor.
Rezumat: Deși analiza mutației promotorului este complexă, adesea laborioasă și dificil de realizat, este o parte esențială a diagnosticului de mutații promotor cauzatoare de boli și ne îmbunătățește înțelegerea rolului reglării transcripționale la om boală. Recomandăm ca laboratoarele de rutină și grupurile de cercetare specializate în cercetarea promotorilor de gene să coopereze pentru a extinde cunoștințele generale și diagnosticul defectelor promotorului de gene.