Yemen WarEdit
În 1962, Egiptul a fost implicat în războiul civil în Yemen, sprijinirea regimului revoluționar al lui Abdullah al-Sallal, care l-a demis pe fostul conducător al țării, Imam Badr, și a declarat republică. Aceasta s-a dovedit a fi o povară financiară și militară considerabilă asupra Egiptului și a creat antipatie față de Arabia Saudită, care a sprijinit loialiștii yemeniti.
1967 WarEdit
Sub presiunea arabă și ca urmare a creșterii așteptărilor populare ale armatei arabe , la 18 mai 1967, Nasser îi cere secretarului general al ONU U Thant să retragă Forța de Urgență a Națiunilor Unite (UNEF) staționată la marginea Egiptului cu frontiera cu Israelul în Sinai. Egiptul a închis strâmtoarea Tiran pentru transportul israelian în represalii pentru deturnarea râului Iordan de către Israel. Regele Hussein al Iordaniei a vizitat Cairo la 30 mai, semnând un pact de apărare iordan-egiptean.
La 5 iunie, Forțele armatei israeliene au dat o lovitură zdrobitoare Egiptului. Șaptesprezece aerodromuri egiptene au fost atacate și cea mai mare parte a forțelor aeriene egiptene au fost distruse la sol, ducând la ocuparea israeliană a peninsulei Sinai. Iordania a intrat în război de partea Egiptului, dar a fost forțată să accepte o încetare a focului Consiliului de Securitate al ONU la 7 iunie după ce Israelul a ocupat teritoriile controlate de Iordania din Cisiordania și Fâșia Gaza controlată de Egipt. Egiptul a acceptat și încetarea focului. Trupele israeliene au atacat instalațiile militare strategice din înălțimile Golanului sirian, ocupând orașul Quneitra. Siria a acceptat încetarea focului la 10 iunie.
Înfrângerea Egiptului în războiul din 1967 l-a obligat pe Nasser să demisioneze la 9 iunie, numind vicepreședintele Zakaria Mohieddin drept succesorul său. Totuși, el a cedat în urma demonstrațiilor populare masive ale Șapte ofițeri de rang înalt au fost judecați în urma înfrângerii, inclusiv ministrul războiului Shams Badran. Comandantul șef al forțelor armate Mareșalul Abdel-Hakim Amer a fost arestat și se spune că s-a sinucis în timp ce se afla în custodie în august.