Kontekst: Chociaż wiadomo, że mutacje promotora powodują istotne funkcjonalnie konsekwencje dla ekspresji genów, analiza promotora nie jest regularna część diagnostyki DNA.
Treść: Ten przegląd obejmuje różne ważne aspekty analizy mutacji promotora i zawiera proponowaną modelową procedurę badania mutacji promotora. Charakterystyka zmienności sekwencji promotora obejmuje obszerne badanie literatury i baz danych ludzkich mutacji i czynników transkrypcyjnych. Ślad filogenetyczny jest również używany do oceny przypuszczalnego znaczenia interesującego regionu promotora. Po tej analizie in silico na ogół następują testy funkcjonalne in vitro, z których przejściowe i stabilne testy transfekcji są uważane za metody złotego standardu. Testy przesunięcia ruchliwości elektroforetycznej i supershift są wykorzystywane do identyfikacji białek działających w układzie trans, które przypuszczalnie oddziałują z interesującym regionem promotora. Wreszcie, testy immunoprecypitacji chromatyny są niezbędne do potwierdzenia wiązania tych białek z promotorem in vivo.
Podsumowanie: Chociaż analiza mutacji promotora jest złożona, często pracochłonna i trudna do wykonania, jest istotną częścią diagnozy mutacji promotora powodujących chorobę i poprawia nasze zrozumienie roli regulacji transkrypcji u ludzi choroba. Zalecamy współpracę rutynowych laboratoriów i grup badawczych specjalizujących się w badaniach promotorów genów w celu poszerzenia wiedzy ogólnej i diagnostyki defektów promotora genów.