Biopsiebemonstering van maagslijmvlies bij diagnostische endoscopie levert informatie op die niet met andere middelen kan worden verkregen. De meest voorkomende indicatie voor een maagbiopsie is de noodzaak om te weten of de patiënt al dan niet is geïnfecteerd met Helicobacter pylori en of de maag al dan niet gastritisch is. Microscopisch onderzoek van maagbiopsiespecimens geeft, naast de H. pylori-status, informatie over de graad, omvang en topografie van gastritis- en atrofiegerelateerde laesies in de maag. Deze informatie biedt verdere mogelijkheden om het risico en de waarschijnlijkheid van verschillende maagaandoeningen in te schatten. Dit zijn: a) De overheersing of beperking van de H. pylori-gerelateerde gastritis in het antrum correleert sterk met een verhoogd risico op maagzweren en in het bijzonder op zweren van de twaalfvingerige darm (het fenotype van zweren in de twaalfvingerige darm van gastritis). b) De aanwezigheid van atrofische gastritis (verlies van normale klieren) in het gebied van het maaglichaam duidt op een laag risico op maagzweren en ook op een vermindering van het vermogen van de patiënt om zuur af te scheiden. c) Het optreden van gevorderde atrofische gastritis en intestinale metaplasie multifocaal in de maag (gevorderde multifocale atrofische gastritis), en met name in de mindere kromming en hoekige inkeping, zijn kenmerken die wijzen op een verhoogd risico op maagneoplasieën (het maagkankerfenotype van gastritis). ). d) De aanwezigheid van normaal en gezond maagslijmvlies wijst daarentegen op een extreem laag risico op zowel maagzweren als maagkanker. Naast de diagnose van H. pylori-gerelateerde gastritische laesies, kunnen routinematige maagbiopten bevindingen aan het licht brengen die wijzen op speciale vormen van gastritis, zoals eosinofiele, lymfocytische, reactieve of granulomateuze gastritis (bijv. Crohn-gastritis) of Helicobacter heilmannii-gastritis. Deze vormen van gastritis komen incidenteel voor bij een klein percentage van de patiënten die diagnostische gastroscopie ondergaan voor buikklachten.