La iglesia fue fundada en 1939 en Scottdale como Travellers Rest Baptist Church. En 1983, se trasladó a Decatur y adoptó su nombre actual. Eddie Long asumió el cargo de pastor en 1987. En ese momento, la iglesia tenía solo 300 miembros. Desde su instalación, la membresía ha aumentado a 25,000.
En 2002, New Birth fue elegida para presentar la grabación en vivo de Dorinda Clark-Cole, y fue elegida por la familia del rapero y R & La superestrella de B Lisa Left Eye Lopes será la anfitriona del funeral del rapero, quien murió en un accidente automovilístico en La Ceiba, Honduras.
En 2003, New Birth plantó una rama llamada «New Birth Charlotte» en Charlotte, Carolina del Norte. Esa iglesia ya no existe y desde entonces vendió su edificio. Los registros del condado de Mecklenburg muestran que la iglesia no cumplió con sus pagos a Evangelical Christian Credit Union por un préstamo de $ 10 millones.
El 15 de agosto de 2004, la iglesia abrió una sucursal llamada «New Birth Memphis» en Memphis, Tennessee. Desde entonces, la iglesia ha cerrado y New Birth Memphis ya no existe.
Luego, en los años futuros, hubo más iglesias como New Birth Metro, New Birth Knoxville, New Birth Oakland y New Birth California.
En 2006, la iglesia fue elegida por la familia de Coretta Scott King, viuda de Martin Luther King Jr., para albergar y oficiar su funeral. El evento contó con la participación de cuatro presidentes (George HW Bush, Bill Clinton, George W. Bush y Jimmy Carter).
El 15 de enero de 2017, el obispo Eddie Long murió de una forma agresiva de cáncer según un declaración emitida por la iglesia. Luego, la iglesia anunció que Stephen A. Davis, pastor de New Birth Birmingham en Birmingham, Alabama, sería el sucesor de Long en la Iglesia Bautista Misionera New Birth en Lithonia mientras seguía siendo pastor de Birmingham. Sin embargo, en junio de 2018, el obispo Davis renunció.
El 19 de noviembre de 2018, la iglesia anunció que Jamal Bryant, pastor de Empowerment Temple AME Church en Baltimore, Maryland, se convertiría en el nuevo pastor de New Birth. El pastor Bryant renunció como pastor de Empowerment Temple a principios de diciembre.