Bakgrunn: Selv om promotermutasjoner er kjent for å forårsake funksjonelt viktige konsekvenser for genuttrykk, er promoteranalyse ikke en vanlig del av DNA-diagnostikk.
Innhold: Denne gjennomgangen dekker forskjellige viktige aspekter av promotermutasjonsanalyse og inkluderer en foreslått modellprosedyre for å studere promotormutasjoner. Karakterisering av en promotorsekvensvariasjon inkluderer en omfattende studie av litteraturen og databaser over menneskelige mutasjoner og transkripsjonsfaktorer. Fylogenetisk fotavtrykk brukes også til å evaluere den antatte betydningen av promoterregionen av interesse. Dette i silico-analyse blir generelt fulgt av in vitro funksjonelle analyser, hvorav forbigående og stabile transfeksjonsanalyser anses som gullstandardmetodene. Elektroforetisk mobilitetsskift og supershift-analyser brukes til å identifisere transvirkende proteiner som antas å interagere med promoter-regionen av interesse. Til slutt er kromatinimmunutfellingsanalyser avgjørende for å bekrefte in vivo binding av disse proteinene til promoteren.
Oppsummering: Selv om promotermutasjonsanalyse er kompleks, ofte arbeidskrevende og vanskelig å utføre, er den en viktig del av diagnosen sykdomsfremkallende promotormutasjoner og forbedrer vår forståelse av rollen som transkripsjonsregulering i mennesker sykdom. Vi anbefaler at rutinelaboratorier og forskningsgrupper spesialisert på genpromotorforskning samarbeider for å utvide generell kunnskap og diagnose av genpromotordefekter.