Den moderne byen
På 1900-tallet utvidet San Juan seg raskt utover sine inngjerdede rammer (nå kjent som Old San Juan) for å innlemme forstads Miramar, Santurce , og Condado, langs kysten, samt industrielle Hato Rey, med sitt store sportsstadion og moderne økonomiske distrikt, og byen Río Piedras, rett i sørøst. I 1980 inkluderte hovedstadsområdet i San Juan de omkringliggende kommunene i øst og vest og hadde omtrent en tredjedel av Puerto Ricos totale befolkning; den andelen har vokst til to tredjedeler av befolkningen. I et trekk for å desentralisere den gamle byen ble mange offentlige kontorer og byråer flyttet over bukten, men guvernørens palass har fortsatt vært i bruk. Trafikkbelastning ble et alvorlig problem etter hvert som byen vokste, og i et forsøk på å redusere bilbruken, ble den første linjen i et regionalt jernbanesystem for hurtigtransport åpnet i 2004.
Storbyområdet San Juan er det største industri- og prosesseringssenteret på øya, med anlegg for raffinering av petroleum og sukker, tobakkforedling, brygging og destillering av rom. Sement, legemidler, metallprodukter og klær produseres også. San Juan er øyas finansielle hovedstad, og mange amerikanske banker og selskaper har kontorer eller distribusjonssentre der. Turisme er en viktig komponent i den lokale økonomien, og besøkende blir dratt til det omfattende restaurerte gamle San Juan-distriktet og områdets luksushotellhoteller (spesielt i Condado). Havnen i San Juan håndterer både last og et stort antall cruiseskip, og byens internasjonale flyplass (oppkalt etter Luis Muñoz Marín, øyas første valgte guvernør) ligger like utenfor gamle San Juan; begge fasilitetene er blant de travleste i Karibia.
© Michael Levy
Hovedcampus ved Universitetet i Puerto Rico (1903) ligger i Río Piedras barrio (avdeling) i San Juan. Medisinsk campus og andre fasiliteter ved universitetet ligger også i San Juan. I 1957 ble universitetet hjemmet til Casals Festival (nå avholdt i Santurce, San Juans viktigste boligforstad), grunnlagt av Pablo Casals. Byens andre utdanningsinstitusjoner inkluderer University of the Sacred Heart (1935) og en campus for det interamerikanske universitetet i Puerto Rico (1912). Puerto Rico kunstmuseum, som kombinerer en ny struktur på fem etasjer med en tidligere sykehusbygning, åpnet i 2000. Merkbare årlige begivenheter i tillegg til Casals-festivalen er San Sebastian Street Festival i januar og San Juan Bautista (St. John Baptist) -festivalen i juni.