科学者は3種類のFISHプローブを使用しており、それぞれの用途は異なります。
遺伝子座特異的プローブはaの特定の領域に結合します。染色体。このタイプのプローブは、科学者が遺伝子のごく一部を分離し、その遺伝子がどの染色体上にあるか、または特定のゲノム内に遺伝子のコピーがいくつ存在するかを調べたい場合に役立ちます。
アルフォイドまたはセントロメア反復プローブは、各染色体の中央にある反復配列から生成されます。研究者はこれらのプローブを使用して、個人が正しい数の染色体を持っているかどうかを判断します。これらのプローブを「遺伝子座特異的プローブ」と組み合わせて使用して、特定の染色体から遺伝物質が欠落しているかどうかを判断することもできます。
染色体全体のプローブは、実際には小さなプローブのコレクションであり、それぞれが与えられた染色体の長さに沿った異なる配列。科学者は、異なる蛍光色素の混合物で標識された複数のプローブを使用して、各染色体を独自の色で標識することができます。結果として得られる染色体のフルカラーマップは、スペクトル核型として知られています。全染色体プローブは、たとえば、ある染色体の一部が別の染色体の端に付着している場合など、染色体異常を調べるのに特に役立ちます。
多くのアプリケーションでは、FISHは主にマイクロアレイの使用に置き換えられています。 。ただし、FISHは一部のテストで引き続き役立ちます。 FISHは、関連する種全体の遺伝子の染色体配列間の比較を研究するためにも使用できます。