星状細胞からの投射は、血液の一部である血管の壁にも広がります-脳関門であり、多くの場合、これらの血管を完全に囲んでいます。アストロサイトのエンドフィートと呼ばれるこれらの予測は、血液脳関門の形成に重要な役割を果たしているようです。たとえば、それらは、内皮細胞が血液脳関門を作成するために必要な密着結合を形成するように促すシグナル伝達に関与していると考えられています。また、血液脳関門の維持や、特別な状況で重要な物質が通過できるようにするための一時的な血液脳関門の開放など、複数の機能があるようです。
脳内のほとんどの血管は血液脳関門に閉じ込められていますが、血液脳関門がない領域もあり、物質が血液から脳に、またはその逆に自由に通過できるようになっています。たとえば、脳室周囲器官は、脳室を中心とする血液脳関門を欠く構造のグループです。脳室周囲器官の血管は、ある理由でより透過性があると考えられています。たとえば、下垂体後部はホルモンを血流に直接放出する必要があり、脳弓下器官は心臓血管の調節に関与しており、血液中のホルモンのレベルを監視するために循環系にアクセスする必要があります。
血液脳関門は末梢血循環と脳の間の重要な保護層ですが、特定の状況では、脳へのアクセスが非常に制限されていることが問題になる可能性があります。たとえば、脳の感染症があるまれな例では、血液脳関門が抗菌剤の脳への送達を非常に困難にします。また、体から脳への抗体の通過を妨げます。これらの場合、血液脳関門は治療の障害となる可能性がありますが、一般的には、体の循環血液と脳の間に不可欠な緩衝液を提供します。