Background: sebbene sia noto che le mutazioni del promotore causano conseguenze funzionalmente importanti per lespressione genica, lanalisi del promotore non è regolare parte della diagnostica del DNA.
Contenuto: questa recensione copre diversi aspetti importanti dellanalisi delle mutazioni del promotore e include una procedura modello proposta per lo studio delle mutazioni del promotore. La caratterizzazione di una variazione di sequenza del promotore include uno studio completo della letteratura e dei database delle mutazioni umane e dei fattori di trascrizione. Limpronta filogenetica viene utilizzata anche per valutare limportanza presunta della regione di interesse del promotore. Questa analisi in silico è, in generale, seguita da test funzionali in vitro, di cui i test di trasfezione transitori e stabili sono considerati i metodi gold-standard. I saggi di spostamento elettroforetico della mobilità e supershift vengono utilizzati per identificare proteine trans-attive che interagiscono presumibilmente con la regione di interesse del promotore. Infine, i saggi di immunoprecipitazione della cromatina sono essenziali per confermare il legame in vivo di queste proteine al promotore.
Riepilogo: sebbene lanalisi delle mutazioni del promotore sia complessa, spesso laboriosa e difficile da eseguire, è una parte essenziale della diagnosi delle mutazioni del promotore che causano malattie e migliora la nostra comprensione del ruolo della regolazione trascrizionale nelluomo malattia. Raccomandiamo che i laboratori di routine ei gruppi di ricerca specializzati nella ricerca sui promotori genici cooperino per espandere la conoscenza generale e la diagnosi dei difetti del promotore genico.