Il miglior combattente indiano dAmerica
Con la fine della guerra civile, i cittadini soldati dei Volontari statunitensi si sciolsero . Custer tornò al grado di capitano nellesercito regolare, anche se fu promosso tenente colonnello e divenne comandante ad interim del 7 ° reggimento di cavalleria degli Stati Uniti. Nel 1866 Custer e la sua settima cavalleria si recarono nel Kansas occidentale per prendere parte alla spedizione del Magg. Gen. Winfield S. Hancock per intimorire gli indiani delle pianure ostili con la forza militare dellesercito degli Stati Uniti. Incapace di adattarsi con successo alla guerra indiana, Custer iniziò ad agire in modo irregolare. Ha ordinato ai disertori fucilati senza processo. Invece di aspettare che le provviste venissero caricate a Fort Wallace, abbandonò il suo reggimento e andò a Fort Riley per visitare sua moglie. Una corte marziale di Fort Leavenworth dichiarò Custer colpevole di cattiva condotta nel 1867 e lo sospese dal rango e dalla paga per un anno.
Custer e sua moglie, Elizabeth (Libbie) Bacon Custer, erano profondamente legati luno allaltra e scrivevano lunghe lettere appassionate quando si separarono. Erano partner nella romantica ricerca della gloria e della fama di Custer, recitando i ruoli del cavaliere e della sua dama. Si diceva che Custer avesse una presenza e una sensibilità teatrali. Profumò i suoi capelli biondi a cascata e aumentò le sue uniformi spesso specializzate (che vanno da una giacca di velluto broccato durante la guerra civile ai pelli di daino di un uomo di frontiera in Occidente) con una cravatta rossa e un grande cappello a tesa larga (che proteggeva anche la sua pelle chiara da scottature).
Lincapacità dellesercito di sottomettere gli indiani delle pianure indusse i superiori di Custer a dare una seconda possibilità a un soldato con i suoi istinti aggressivi. Lo riportarono in servizio prima della scadenza della sua condanna alla corte marziale e nel settembre 1868 si riunì alla 7a Cavalleria nel Kansas sudoccidentale. A novembre il suo comando sorprese e distrusse il villaggio del capo dei Cheyenne del sud, Black Kettle, sul fiume Washita. (Black Kettle e il suo popolo erano già stati lobiettivo di un controverso attacco a sorpresa da parte dellesercito nel 1864, noto come il massacro di Sand Creek). Questo successo alquanto dubbio: si pensa che la maggior parte degli indiani fossero donne, bambini e anziani persone piuttosto che guerrieri: fu la prima grande vittoria dellesercito sulle tribù delle pianure meridionali dopo la guerra civile e stabilì la reputazione di Custer come il miglior combattente indiano dAmerica, che mantenne ben dopo che le gesta di altri ufficiali dellesercito avevano superato la sua.
Nel 1874 Custer guidò una spedizione per indagare sulle voci di depositi doro nelle Black Hills del territorio del Dakota (ora nel Sud Dakota occidentale e nel Wyoming nord-orientale). La regione era stata riconosciuta da un trattato come il sacro terreno di caccia dei potenti Lakota Sioux. I rapporti esagerati di Custer scatenarono una corsa alloro, tuttavia, e il governo degli Stati Uniti ordinò che i Sioux ei loro alleati Cheyenne del Nord si trasferissero nelle riserve entro il 31 gennaio 1876, o fossero considerati “ostili”.