A gyomornyálkahártya biopsziás mintavétele a diagnosztikus endoszkópián olyan információkat nyújt, amelyeket más módon nem lehet beszerezni. A gyomorbiopszia leggyakoribb javallata annak ismerete, hogy a beteg Helicobacter pylori fertőzött-e vagy sem, és a gyomor gastritikus-e vagy sem. A gyomorbiopsziás minták mikroszkópos vizsgálata a H. pylori státusz mellett információt nyújt a gyomor gyulladásával és atrófiájával kapcsolatos elváltozások fokozatáról, mértékéről és topográfiájáról. Ez az információ további lehetőségeket kínál a különféle gyomorbetegségek kockázatának és valószínűségének felmérésére. Ezek a következők: a) A H. pylori-val összefüggő gastritis túlsúlya vagy korlátozása az antrumban szorosan korrelál a peptikus fekélybetegség, és különösen a nyombélfekély (a gastritis duodenális fekély fenotípusa) fokozott kockázatával. b) Az atrófiás gyomorhurut (a normál mirigyek elvesztése) jelenléte a gyomortest területén alacsony fekélyveszélyt és a páciens savelválasztási képességének csökkenését jelzi. c) Az előrehaladott atrófiás gyomorhurut és a bél metapláziája multifokálisan a gyomorban (előrehaladott multifokális atrófiás gastritis), különösen a kisebb görbületben és a szögletes rovátkában a gyomor neopláziák (a gastritis gyomorrák fenotípusa) fokozott kockázatára utal. ). d) A normál és egészséges gyomornyálkahártya jelenléte viszont a peptikus fekélybetegség és a gyomorrák rendkívül alacsony kockázatát jelzi. A H. pylori-val összefüggő gasztritikus elváltozások diagnosztizálása mellett a rutinszerű gyomorbiopsziák olyan felfedezéseket tárhatnak fel, amelyek a gasztritisz speciális formáira utalnak, mint például eozinofil, limfocita, reaktív vagy granulomatózus gyomorhurut (pl. Crohn-féle gyomorhurut) vagy Helicobacter heilmannii gasztritisz . Az ilyen típusú gyomorhurut véletlenül a betegek kis százalékában található meg, akik hasi panaszok miatt diagnosztikus gasztroszkópián esnek át.