FitzRoy meghívta Darwint, hogy a természettudományi részleggel járuljon hozzá a kapitány beszámolójához Beagle útjáról. Helyszíni feljegyzéseinek és naplójának felhasználásával, amelyet családja számára küldött el olvasni, 1837 szeptemberéig elkészítette ezt a részt. FitzRoy-nak szerkesztenie kellett Beagle előző kapitányának feljegyzéseit, valamint meg kellett írnia saját beszámolóját az útról. és két hajó korábbi expedíciói.
A beszámolót négy kötetként fejezték be és tették közzé 1839 májusában Őfelsége “Hajói kaland és Beagle” felmérési útjainak elbeszéléseként. Az első kötet lefed. az első utazás Phillip Parker King parancsnok irányításával, a második kötet FitzRoy beszámolója a második utazásról. A harmadik kötetet Darwin 1832–1835 című folyóirata alkotja, a negyedik kötet pedig hosszadalmas függelék. FitzRoy beszámolója tartalmaz olyan megjegyzéseket, amelyek a vízözönre utalnak, amelyben korábbi érdeklődését visszavonta Charles Lyell geológiai írásai iránt. az expedíció során Darwinnak tett észrevételei, miszerint az üledékjellemzőket “negyven napos” áradás “soha nem érhette volna el, megerősítve elkötelezettségét a Biblia szó szerinti olvasása mellett. A hajó visszatérésekor feleségül vette és a feleség nagyon vallásos volt.
Darwin közreműködése rendkívül népszerűnek bizonyult, és a kiadó, a londoni Henry Colburn felvállalta Darwin szövegének újbóli kiadását augusztusban, új címlappal a Journal of Researches into a HMS által látogatott különböző országok geológiája és természettörténete Beagle nyilvánvalóan anélkül, hogy Darwin engedélyét kérte volna vagy díjat fizetett volna neki.
Második kiadás: az evolúció ötleteinek módosítása
Illusztráció a Természettudományi és Földtani Kutatások Lapjából
Az 1845-ös második kiadás kiterjedt módosításokat tartalmazott, amelyek a terület értelmezése tükrében készültek Gyűjtemények és az evolúcióval kapcsolatos ötletek kidolgozása. Ezt a kiadást John Murray kiadó rendelte meg, aki valójában 150 fontot fizetett Darwinnak a szerzői jogokért. A teljes címet a Journal of Researches on the History of Natural History and Geology magazin módosította. a HMS Beagle utazása a világ körül.
Az első kiadásban Darwin megjegyzi a galápagosi élővilág hasonlóságát a dél-amerikai kontinensen: “A körülményeket a nézetek szerint megmagyaráznák. egyes szerzők állításával, mondván, hogy a teremtő erő a t ugyanazon törvény széles területen “. (Ezt Charles Lyell „teremtési központok” -ra vonatkozó elképzeléseire hivatkozva írták.) Darwin megjegyzi a pintyfajok csőrének méretbeli fokozatosságát, azt gyanítja, hogy a fajok „különböző szigetekre korlátozódnak”, „De van nem helyet ebben a munkában, hogy belevághasson ebbe a kíváncsi témába. “
A későbbi kiadások utalnak az evolúcióval kapcsolatos új elképzeléseire:
Figyelembe véve ezeknek a szigeteknek a kis méretét, csodálkozóbbnak érezzük őslakóik számát és szűk körét … geológiai szempontból legutóbbi időszakban a töretlen óceán itt terjedt el. Ezért mind térben, mind időben, úgy tűnik, hogy valamelyest közel állunk ahhoz a nagyszerű tényhez – a rejtélyek rejtélyéhez -, hogy új lények először megjelennek ezen a földön.
Apropó a pintyekről a csőrméretük szerint azt írja: “igazán elképzelhető, hogy e szigetcsoport eredeti madárhiányából egy fajt vettek és módosítottak különböző célokra. “
1890-ben John Murray megjelentette a könyv illusztrált kiadását Robert Taylor Pritchett művész javaslatára, aki már ismert volt a RYS Wanderer és a Sunbeam kísérő útjairól, és produkált ezeken a körutazásokon használt könyvekben használt képek. A Journal and Researches e kiadásának előszavában Murray elmondta, hogy “ebben a munkában a nézetek többsége Mr. Pritchett helyszínen készített vázlataiból áll, Mr. Darwin könyvével az oldalán”, és az illusztrációk. “a legnagyobb gonddal és fájdalommal választották és ellenőrizték”.