Contexte: Bien que les mutations du promoteur soient connues pour avoir des conséquences fonctionnellement importantes pour lexpression génique, lanalyse du promoteur nest pas partie du diagnostic ADN.
Contenu: Cette revue couvre différents aspects importants de lanalyse des mutations du promoteur et comprend une proposition de procédure modèle pour étudier les mutations du promoteur. La caractérisation dune variation de séquence de promoteur comprend une étude approfondie de la littérature et des bases de données des mutations humaines et des facteurs de transcription. Lempreinte phylogénétique est également utilisée pour évaluer limportance putative de la région dintérêt promoteur. Cette analyse in silico est, en général, suivie par des tests fonctionnels in vitro, dont les tests de transfection transitoire et stable sont considérés comme les méthodes de référence. Les dosages de déplacement de mobilité électrophorétique et supershift sont utilisés pour identifier les protéines à action trans qui interagissent putativement avec la région promotrice dintérêt. Enfin, les dosages dimmunoprécipitation de la chromatine sont essentiels pour confirmer la liaison in vivo de ces protéines au promoteur.
Résumé: Bien que lanalyse des mutations du promoteur soit complexe, souvent laborieuse et difficile à réaliser, elle est une partie essentielle du diagnostic des mutations du promoteur causant des maladies et améliore notre compréhension du rôle de la régulation transcriptionnelle chez lhomme maladie. Nous recommandons que les laboratoires de routine et les groupes de recherche spécialisés dans la recherche sur les promoteurs de gènes coopèrent pour élargir les connaissances générales et le diagnostic des défauts des promoteurs de gènes.