Simuloitu esimerkki (idealisoitu) subtraktiivinen värien sekoitus. Oletetaan, että ulkoinen valonlähde on, ja jokainen ensisijainen vaimentaa (absorboi) osan valosta. Tavalliset subtraktiiviset alkusyaanit syaani, purppura ja keltainen yhdistyvät pareittain, jolloin subtraktiivisista sekundaareista tehdään punaista, vihreää ja sinistä (jotka ovat additiivisia primaareja tai käytännössä hieman tummempia ja vähemmän kyllästettyjä versioita tyypillisistä additiivisista primaareista). Kaikkien kolmen primaarin (keskellä) yhdistäminen absorboi kaiken valon, mikä johtaa mustaan. Todellisissa pigmenteissä tuloksia vaikeuttaisi jonkin verran peittävyys ja sekoituskäyttäytyminen, ja käytännössä neljännen pigmentin, kuten mustan, lisääminen voi olla hyödyllistä.
Värillisten fyysisten sekoittaminen aineet vastaavat subtraktiivista värien sekoitusta, joten se vastaa intuitiomme värien sekoittamisesta. Mekanismin selittämiseksi harkitse punaisen maalin sekoittamista keltaiseen maaliin. Punainen maali on punainen, koska kun ympäröivä valo osuu siihen, materiaalin koostumus on sellainen, että se absorboi kaikki muut värit näkyvällä spektrillä paitsi punaisella. Punainen valo, joka ei imeydy, heijastuu maalista ja on se, mitä näemme. Tämä sama mekanismi kuvaa materiaalikohteiden väriä – huomaa, että valo ei ole aineellinen esine – ja pätee myös keltaiseen maaliin. Käyttäen yllä olevaa kuvaa, joka osoittaa lisäaineiden värien sekoittumisen, nähdään, että keltainen valo koostuu punaisen ja vihreän valon (lisäaine) seoksesta. Kun sekoitamme kaksi maalia, tuloksena olevalla aineella on punainen maali ja keltainen maali. Keltainen maali absorboi kaikki värit paitsi punaisen ja vihreän. Punainen maali absorboi kuitenkin keltaisen maalin heijastaman vihreän. Punainen maali voidaan sanoa vähentävän vihreän keltaisesta maalista. Tuloksena oleva maali heijastaa vain punaista valoa ja näyttää siten punaiselta silmillemme. Huomaa kuitenkin, että tämä kuvaus on teoreettinen ja että pigmenttien sekoittaminen ei vastaa ihanteellista vähennysvärisekoitusta, koska osa vähennetystä väristä heijastaa edelleen alkuperäisen maalin yhtä komponenttia. Tämä johtaa tummempaan ja tyydyttymättömään väriin verrattuna ihanteellisten suodattimien kanssa saatavaan väriin. värimalli ja CMYK-värimalli, jota käytetään laajalti väritulostuksessa. Subtraktiivisessa värien sekoittamisessa värin puuttuminen on valkoista ja kaikkien kolmen päävärin läsnäolo tekee neutraalista tummanharmaasta tai mustasta. Toissijaiset värit ovat samat kuin lisäaineiden sekoittamisen päävärit ja päinvastoin. Subtraktiivista sekoitusta käytetään luomaan erilaisia värejä, kun tulostetaan tai maalataan paperille tai muulle valkoiselle alustalle, yhdistämällä pieni määrä muste- tai maalivärejä. Punainen syntyy sekoittamalla magenta ja keltainen (poistamalla vihreä ja sininen). Vihreä syntyy sekoittamalla syaani ja keltainen (poistamalla vastaavasti punainen ja sininen). Sininen syntyy sekoittamalla syaani ja purppura (poistamalla punainen ja vihreä). Mustaa voidaan arvioida sekoittamalla syaani, purppura ja keltainen, vaikka todelliset pigmentit eivät ole ihanteellisia, joten puhdasta mustaa on lähes mahdotonta saavuttaa.