Takoyaki suosittiin ensimmäisen kerran Osakassa, jossa Tomekichi Endo -niminen katukauppias hyvitetään keksintöään vuonna 1935. Takoyaki sai inspiraationsa akashiyakista, pienestä pyöreästä nyytistä Akashin kaupungista Hyōgossa. Prefektuuri, joka on valmistettu munarikkaasta taikinasta ja mustekalasta. Takoyaki oli alun perin suosittu Kansain alueella, ja levisi myöhemmin Kantō-alueelle ja muille Japanin alueille. Takoyaki liittyy yatai-katuruokakioskeihin, ja erityisesti Kansain alueella on monia vakiintuneita takoyaki-erikoisravintoloita. Takoyakia myydään nyt kaupallisissa myyntipisteissä, kuten supermarketeissa ja ympäri vuorokauden auki olevissa lähikaupoissa.
Se on myös erittäin suosittu taiwanilaisessa keittiössä japanilaisen kulttuurin historiallisen vaikutuksen vuoksi.
vanhin tunnettu takoyaki-myymälä on Aizuya Osakassa. Tomakichi Endon perustama se on ollut avoinna 1930-luvulta lähtien. Ensimmäinen takoyaki sisälsi naudanlihaa ja konjacia, mutta myöhemmin Endo siirtyi käyttämään nyt perinteistä mustekalaa ja lisäsi makua taikinaan. Takoyakit syödään sitten ruskean kastikkeen kanssa, samanlainen kuin Worcestershire-kastike. Ruokasta, joka tunnetaan nimellä ”mustekala pallot”, tuli nopeasti suosittu kaikkialla Japanissa.