Astrosyyttien projektiot ulottuvat myös verisuonien seinämiin -aivoesteen ja ympäröivät usein nämä alukset kokonaan. Näillä ennusteilla, joita kutsutaan astrosyyttisiksi pääjalkoiksi, näyttää olevan tärkeä rooli veri-aivoesteen muodostumisessa. Esimerkiksi heidän uskotaan osallistuvan signalointiin, joka saa endoteelisolut muodostamaan tiukat liitokset, jotka ovat välttämättömiä veri-aivoesteen luomiseksi. Niillä näyttää myös olevan useita toimintoja, joihin kuuluu veri-aivoesteen ylläpito ja mahdollisesti esteen ohimenevä avautuminen, jotta tärkeät aineet pääsevät ylittymään erityisissä olosuhteissa.
Vaikka suurin osa aivojen verisuonista on suljettu veri-aivoesteeseen, joillakin alueilla ei ole veri-aivoestettä, jolloin aineet voivat siirtyä verestä aivoihin ja päinvastoin vapaammin. Esimerkiksi ympärysmittaiset elimet ovat ryhmä rakenteita, joista puuttuu veri-aivoesteet ja jotka ovat keskittyneet aivojen kammioiden ympärille. Uskotaan, että verisuonia ympäröivissä elimissä on läpäisevämpiä syystä; esimerkiksi aivolisäkkeen takaosan on vapautettava hormoneja suoraan verenkiertoon, ja subfornikaalinen elin on mukana sydän- ja verisuonitautien säätelyssä, mikä edellyttää pääsyä verenkiertoon veren hormonitasojen seuraamiseksi.
Vaikka veri-aivoesteet ovat tärkeä suojakerros ääreisverenkierron ja aivojen välillä, voi tietyissä tilanteissa olla ongelmallista, että pääsy aivoihin on niin rajoittavaa. Esimerkiksi harvoissa tapauksissa, joissa on aivoinfektio, veri-aivoesteet vaikeuttavat antimikrobisten aineiden kuljettamista aivoihin; se myös estää vasta-aineiden kulkeutumisen kehosta aivoihin. Vaikka näissä tapauksissa veri-aivoeste voi olla este hoidolle, se yleensä tarjoaa välttämättömän puskurin kehon verenkierron ja aivojen välillä.