Hintergrund: Obwohl bekannt ist, dass Promotormutationen funktionell wichtige Konsequenzen für die Genexpression haben, ist die Promotoranalyse nicht regelmäßig Teil der DNA-Diagnostik.
Inhalt: Diese Übersicht behandelt verschiedene wichtige Aspekte der Promotormutationsanalyse und enthält ein vorgeschlagenes Modellverfahren zur Untersuchung von Promotormutationen. Die Charakterisierung einer Promotorsequenzvariation umfasst eine umfassende Untersuchung der Literatur und Datenbanken menschlicher Mutationen und Transkriptionsfaktoren. Der phylogenetische Fußabdruck wird auch verwendet, um die mutmaßliche Bedeutung der interessierenden Promotorregion zu bewerten. Auf diese In-Silico-Analyse folgen im Allgemeinen In-vitro-Funktionstests, von denen transiente und stabile Transfektionstests als Goldstandardmethoden gelten. Elektrophoretische Mobilitätsverschiebungs- und Supershift-Assays werden verwendet, um transaktive Proteine zu identifizieren, die mutmaßlich mit der interessierenden Promotorregion interagieren. Schließlich sind Chromatin-Immunpräzipitationstests wesentlich, um die in vivo-Bindung dieser Proteine an den Promotor zu bestätigen.
Zusammenfassung: Obwohl die Analyse von Promotormutationen komplex, oft mühsam und schwierig durchzuführen ist, ist sie ein wesentlicher Bestandteil der Diagnose krankheitsverursachender Promotormutationen und verbessert unser Verständnis der Rolle der Transkriptionsregulation beim Menschen Krankheit. Wir empfehlen Routinelabors und Forschungsgruppen, die auf Genpromotorforschung spezialisiert sind, zusammenzuarbeiten, um das allgemeine Wissen und die Diagnose von Genpromotordefekten zu erweitern.