I 1895 var en søjle af lejesoldater i beskæftigelse af Cecil John Rhodes “Rhodesian-baserede Charter Company og ledet af kaptajn Leander Starr Jameson gået ind i ZAR med den hensigt at gnist et oprør ved Witwatersrand og installation af en britisk administration der. Den væbnede indtrængen blev kendt som Jameson Raid. Det sluttede, da den invaderende søjle blev baghold og fanget af Boer-kommandoer. Præsident Kruger mistænkte, at oprøret i det mindste havde modtaget den stiltiende godkendelse af Cape Colony-regeringen under premierministeriet af Cecil John Rhodes, og at Kruger Sydafrikanske Republik stod overhængende fare. Kruger reagerede ved at danne en alliance med den nærliggende Boerrepublik Orange Free State. Dette forhindrede ikke udbruddet af en anden Anglo-Boer-krig.
Anden Anglo-Boer WarEdit
Emily Hobhouse kæmpede mod de forfærdelige forhold i de britiske koncentrationslejre i Sydafrika og påvirkede således den britiske offentlige mening mod krigen.
Fornyede spændinger mellem Storbritannien og boerne toppede i 1899, da briterne krævede stemmeret for de 60.000 udenlandske hvide ved Witwatersrand. Indtil dette tidspunkt havde præsident Paul Krugers regering udelukket alle udlændinge fra franchisen. Kruger afviste den britiske efterspørgsel og opfordrede til tilbagetrækning af britiske tropper fra den sydafrikanske republiks grænser. Da briterne nægtede, erklærede Kruger krig. Dette Anden anglo-boerkrig, også kendt som den sydafrikanske krig, varede længere end den første, hvor britiske tropper blev suppleret med kolonitropper fra det sydlige Rhodesia, Canada, Indien, Australien og New Zealand. Det er blevet anslået, at det samlede antal britiske og kolonitropper indsat i Sydafrika under krigen overgik befolkningen i de to boerrepublikker med mere end 150.000.
I juni 1900 var Pretoria, den sidste af de store boerbyer, overgivet. Boer bittereinders (hvilket vil sige dem, der kæmper til den bitre ende) fortsatte i yderligere to år med guerilla-krigsførelse, som briterne mødte igen med brændt jordtaktik. Boerne fortsatte med at kæmpe.
Den britiske suffragette Emily Hobhouse besøgte britiske koncentrationslejre i Sydafrika og udarbejdede en rapport der fordømte de forfærdelige forhold der. I 1902 var 26.000 Boer-kvinder og børn døde af sygdom og forsømmelse i lejrene.
Anglo-Boer-krigen ramte alle racegrupper i Sydafrika. Sorte mennesker blev hvervet eller på anden måde tvunget af begge sider til at arbejde for dem enten som stridende eller ikke-stridende for at opretholde den respektive krigsindsats for både boerne og briterne. De officielle statistikker over sorte dræbt i aktion er unøjagtige. De fleste af ligene blev dumpet i umærkede grave. Det er imidlertid blevet bekræftet, at 17.182 sorte mennesker hovedsagelig døde af sygdomme i Cape koncentrationslejre alene, men dette tal accepteres ikke historisk som en sand afspejling af det samlede antal. Koncentrationslejrinspektører registrerede ikke altid sorte indsattes død i lejrene.
Fra begyndelsen af fjendtlighederne i oktober 1899 til underskrivelsen af fred den 31. maj 1902 krævede krigen livet for 22.000 kejserlige soldater og 7.000 republikanske krigere. Med hensyn til fredsaftalen kendt som Vereeniging-traktaten anerkendte Boerrepublikkerne britisk suverænitet, mens briterne igen forpligtede sig til genopbygning af de områder, der var under deres kontrol.