Baggrund: Selvom promotormutationer vides at forårsage funktionelt vigtige konsekvenser for genekspression, er promotoranalyse ikke en regelmæssig del af DNA-diagnostik.
Indhold: Denne gennemgang dækker forskellige vigtige aspekter af promotormutationsanalyse og inkluderer en foreslået modelprocedure til undersøgelse af promotormutationer. Karakterisering af en promotorsekvensvariation inkluderer en omfattende undersøgelse af litteraturen og databaser over humane mutationer og transkriptionsfaktorer. Fylogenetisk fodaftryk bruges også til at evaluere den formodede betydning af promotorregionen af interesse. Dette i silico-analyse er generelt efterfulgt af in vitro-funktionelle assays, hvoraf forbigående og stabile transfektionsanalyser betragtes som guldstandardmetoderne. Elektroforetisk mobilitetsforskydnings- og supershift-analyser bruges til at identificere transvirkende proteiner, der formodentlig interagerer med promotorregionen af interesse. Endelig er chromatinimmunudfældningsassays essentielle for at bekræfte in vivo binding af disse proteiner til promotoren.
Resumé: Selvom promotormutationsanalyse er kompleks, ofte besværlig og vanskelig at udføre, er den en væsentlig del af diagnosen sygdomsfremkaldende promotormutationer og forbedrer vores forståelse af rollen som transkriptionsregulering i mennesker sygdom. Vi anbefaler, at rutinelaboratorier og forskningsgrupper specialiseret i genpromotorforskning samarbejder om at udvide generel viden og diagnose af genpromotordefekter.