Biopsiprøvetagning af gastrisk slimhinde ved diagnostisk endoskopi giver information, der ikke kan opnås på anden måde. Den mest almindelige indikation for gastrisk biopsi er behovet for at vide, om patienten er inficeret med Helicobacter pylori eller ej, og om maven er gastritisk eller ej. Mikroskopisk undersøgelse af gastrisk biopsiprøver giver, ud over H. pylori-status, information om kvaliteten, omfanget og topografien af gastritrelaterede og atrofi-relaterede læsioner i maven. Disse oplysninger giver yderligere muligheder for at vurdere risikoen og sandsynligheden for forskellige gastriske lidelser. Disse er: a) Overvejelsen eller begrænsningen af H. pylori-relateret gastritis i antrummet korrelerer stærkt med en øget risiko for peptisk ulcus sygdom og især duodenalsår (duodenalsår fænotype af gastritis). b) Tilstedeværelsen af atrofisk gastritis (tab af normale kirtler) i området i mavekroppen indikerer en lav risiko for mavesår og også en reduktion i patientens evne til at udskille syre. c) Forekomsten af avanceret atrofisk gastritis og tarmmetaplasi multifokalt i maven (avanceret multifokal atrofisk gastritis) og især i mindre krumning og vinkelhak er træk, der tyder på en øget risiko for gastrisk neoplasier (gastrisk kræftfænotype af gastritis ). d) Tilstedeværelsen af normal og sund gastrisk slimhinde indikerer på den anden side en ekstremt lav risiko for både peptisk mavesår og gastrisk kræft. Ud over diagnosen af H. pylori-relaterede gastritiske læsioner kan rutinemæssige gastriske biopsier afsløre fund, der indikerer specielle former for gastritis, såsom eosinofil, lymfocytisk, reaktiv eller granulomatøs gastritis (f.eks. Crohns gastritis) eller Helicobacter heilmannii gastritis Disse typer gastritis kan forekomme tilfældigt hos en lille procentdel af patienter, der gennemgår diagnostisk gastroskopi for abdominale lidelser.