Baltimore havn fra Federal Hill i 1849 med Washington Monument i baggrunden
Mens Baltimore har været en stor amerikansk søhavn siden det 18. århundrede, var det historisk lave vand i den indre havn (før manipulation gennem opmudring) ikke befordrende for store skibe eller tung industri . Disse blev koncentreret i Locust Point, Fells Point og Canton.
I midten af det 20. århundrede led Baltimore af den økonomiske tilbagegang med omstruktureringer, der var fælles for mange industribyer i USA. Gamle havne var opgivet med ankomsten af containerskibe efter Anden Verdenskrig. Senere blev de gamle havne tilpasset som kontaktpunkter til at forbinde byer med deres vandfronter igen og udvikle offentlige rum, turisme, forretning og boliger.
I løbet af 1940erne iværksatte John H. Threadgill, lederen af Steamship Trade Association, en undersøgelse for en en bro over den indre havn i Baltimore var en idé, der blev diskuteret hyppigt. I sin egenskab af leder af foreningen anbefalede Threadgill i sidste ende, at ideen for en bro over havnen skal opgives på grund af det faktum, at Baltimore stolede stærkt på en skibsfart og frygter, at broen negativt vil hindre strømmen af skibsfart ved havnen i Baltimore. Threadgill blev udnævnt til leder af Baltimores havnekommission i 1950erne.
I 1950erne sluttede de økonomiske ændringer både gods- og passagerbrug af den indre havn, såsom dampskibe fra Old Bay Line. Rådnende lagre og moler blev til sidst revet ned og erstattet af åbent, græsdækket parkområde, der blev brugt til rekreative formål og lejlighedsvise store begivenheder.
Havnefronten blev gradvist omdannet med prisvindende parker og pladser omgivet af kontor bygninger, hoteller og fritidsattraktioner, som vendte byens tilbagegang og blev en model for byrenæssance i byer rundt om i verden. Fornyelsen af Baltimores indre havneområde begyndte med vedtagelsen af den 13 hektar store Charles Centerprojekt af byrådet og borgmester Thomas D “Alesandro i marts 1958. Mellem 1958 og 1965 fornyede Baltimore centrum af sit forretningsområde ved at genopbygge Charles Center med kontorbygninger, hoteller og butikker.
I begyndelsen af borgmester Theodore R. McKeldins anden periode i 1963 blev ombygningsprogrammet udvidet til at omfatte 240 hektar (97 ha) omkring den indre havn. Virksomhedens hovedkvarter og hoteller blev bygget omkring den indre havn. En offentlig park og en promenade blev tilføjet til fritidsaktiviteter og samfundssamlinger.
Den 4. juli 1976, efter mødet med Tall Ships i New York for US Bicentennial, besøgte otte skibe fra andre nationer Baltimore, hvor de tiltrak et stort antal turister. Denne interesse var med til at anspore udviklingen af andre turistattraktioner – herunder National Aquarium, Maryland Science Center og Harborplace festivalmarkedet (som drives af The Rouse Company), der åbnede den 4. juli 1980. Det nærliggende Baltimore Convention Center og Hyatt Regency Baltimore Hotel tilføjede tjenesterne og resulterede i befolkningstæthed og besøgende.
Med succesen af den indre havn i 1970erne og 1980erne blev Baltimore et verdensomspændende turistmål og model for byplanlægning og udvikling. Det påvirkede mere end 100 andre byer og vandt mere end 40 nationale eller internationale priser, herunder en henvisning fra American Institute of Architects i 1984 som “en af de største præstationer inden for storskala bydesign og udvikling i USAs historie”. p>
I de senere år er området langs havnefronten øst for den indre havn (i retning af Fells Point og Lille Italien) udviklet med ejerlejligheder, butikslokaler, restauranter og hoteller – et igangværende projekt kendt som havn øst.
Mens der stadig er lidt udviklingsareal omkring den indre havn, har den tilgængelige jord været underlagt mange planer, som ikke er realiseret. Nyligt afsluttede projekter inkluderer udvikling med blandet brug, der omfatter kontorlokaler, detailhandel på gadeniveau og ejerlejligheder samt hotelprojekter såsom Ritz Carlton Residences, et ejerlejlighedsprojekt på Key Highway i det sydøstlige hjørne af den indre havn.
I september 2003 blev det indre havneområde oversvømmet af orkanen Isabel. Baltimore World Trade Center forblev lukket i en måned, men alle de andre bygninger blev reddet fra oversvømmelse af Inner Harbour-udviklingskontrol, som blev oprettet af masterudviklerteamet fra Charles Center-Inner Harbor Management, Inc.
I marts 2004 vendte en vandtaxi om under en storm på den nordvestlige gren af Patapsco-floden nær Fort McHenry. Mens det fandt sted over en kilometer nedstrøms for den indre havn, var ulykken forbundet med den indre havn af nyhedsrapporter og tilfældige observatører. Fem passagerer omkom i ulykken, som National Transportation Safety Board fastslog, var forårsaget, da det lille skib i ponton-stil stødte på uforudsigelig stærk vind og bølger.