Varmere vandtemperaturer kan resultere i koralblegning. Når vandet er for varmt, vil koraller udvise algerne (zooxanthellae), der lever i deres væv, hvilket får koraller til at blive helt hvide. Dette kaldes koralblegning. Når en koral bleges, er den ikke død. Koraller kan overleve en blegningshændelse, men de er under mere stress og er underlagt dødelighed.
I 2005 mistede USA halvdelen af sine koralrev i Caribien på et år på grund af en massiv blegningshændelse. Det varme vand centreret omkring de nordlige Antiller nær Jomfruøerne og Puerto Rico udvidede sydpå. Sammenligning af satellitdata fra de foregående 20 år bekræftede, at termisk stress fra 2005-begivenheden var større end de foregående 20 år tilsammen.
Ikke alle blegningshændelser skyldes varmt vand.
I januar 2010 forårsagede kolde vandtemperaturer i Florida Keys en koralblegningshændelse, der resulterede i en vis koraldød. Vandtemperaturer faldt 12,06 grader Fahrenheit lavere end de typiske temperaturer observeret på denne tid af året. Forskere vil vurdere, om denne kolde stresshændelse vil gøre koraller mere modtagelige for sygdomme på samme måde som varmere farvande påvirker koraller.