Darwin blev inviteret af FitzRoy til at bidrage med den naturhistoriske sektion til kaptajnens beretning om Beagles rejse. Ved hjælp af sine feltnotater og den journal, som han havde sendt hjem til sin familie til at læse, afsluttede han dette afsnit i september 1837. FitzRoy måtte redigere noterne fra den tidligere kaptajn på Beagle samt skrive sin egen beretning om rejsen og de tidligere ekspeditioner med to skibe.
Kontoen blev afsluttet og offentliggjort som et firebind, der blev sat i maj 1839 som fortællingen om landmålingens rejser af hans majestæts skibe Adventure and Beagle. bind 1 dækker den første rejse under kommandør Phillip Parker King, bind to er FitzRoys beretning om den anden rejse. Darwins tidsskrift og bemærkninger, 1832–1835, udgør det tredje bind, og det fjerde bind er et langt bilag. FitzRoys beretning indeholder bemærkninger med henvisning til syndafloden, hvor han tilbagekaldte sin tidligere interesse for de geologiske skrifter fra Charles Lyell og hans bemærkninger til Darwin under ekspeditionen om, at sedimentære træk, de så “aldrig kunne have været påvirket af en fyrre dages” oversvømmelse “, hvilket hævdede hans fornyede forpligtelse til en bogstavelig læsning af Bibelen. Han var gift på skibets tilbagevenden, og hans kone var meget religiøs.
Darwins bidrag viste sig at være bemærkelsesværdigt populært, og forlaget, Henry Colburn fra London, tog det på sig at genudgive Darwins tekst i august med en ny titelside som Journal of Researches into geologi og naturhistorie i de forskellige lande besøgt af HMS Beagle tilsyneladende uden at søge Darwins tilladelse eller betale ham et gebyr.
Anden udgave: ændring af ideer om evolutionEdit
Illustration fra Journal of Researches in the Natural History and Geology
Den anden udgave af 1845 indeholdt omfattende revisioner i lyset af fortolkningen af feltet samlinger og udvikling af ideer om evolution. Denne udgave blev bestilt af udgiveren John Murray, der faktisk betalte Darwin et gebyr på £ 150 for ophavsretten. Den fulde titel blev ændret til Journal of Researches in the Natural History and Geology i de lande, der blev besøgt under HMS Beagles rejse rundt om i verden.
I den første udgave bemærker Darwin med hensyn til ligheden mellem Galápagos-dyrelivet og det på det sydamerikanske kontinent, “Omstændigheden ville blive forklaret i henhold til synspunkterne af nogle forfattere ved at sige, at den kreative kraft havde handlet i overensstemmelse med t han samme lov over et bredt område “. (Dette blev skrevet med henvisning til Charles Lyells idéer om “skabelsescentre”.) Darwin bemærker graderingerne i størrelse af næbearter af finkearter, mistænker at arter “er begrænset til forskellige øer”, “Men der er ikke plads i dette arbejde for at gå ind i dette nysgerrige emne. “
Senere udgaver antyder hans nye ideer om evolution:
I betragtning af disse øers lille størrelse føler vi os mere forbløffede over antallet af deres oprindelige væsener og deres begrænsede rækkevidde … inden for en periode, der var geologisk for nylig, var det ubrudte hav her spredt. Derfor både i rum og tid, vi ser ud til at være bragt noget tæt på den store kendsgerning – det mysterium af mysterier – det første udseende af nye væsener på denne jord.
Apropos finke med deres graderinger i størrelse næb, skriver han “man kunne virkelig tænke sig, at der fra en oprindelig mangel på fugle i denne øhav var taget en art og ændret reddet til forskellige formål. “
I 1890 udgav John Murray en illustreret udgave af bogen på forslag af kunstneren Robert Taylor Pritchett, som allerede var kendt for at ledsage rejser med RYS Wanderer og Sunbeam og producere billeder, der bruges i bøger om disse krydstogter. I sit forord til denne udgave af Journal and Researches sagde Murray, at de fleste “af de synspunkter, der gives i dette arbejde, er fra skitser lavet på stedet af Mr. Pritchett med Mr. Darwins bog ved hans side” og illustrationer var blevet “valgt og verificeret med den største omhu og smerter”.