Synapsis (také nazývaný syndesis) je párování dvou chromozomů, ke kterému dochází během meiózy. Umožňuje srovnání homologních párů před jejich segregací a možné křížení chromozomů mezi nimi. Synapse probíhá během profáze I meiózy. Když se homologní chromozomy synchronizují, jejich konce jsou nejprve připojeny k jaderné obálce. Tyto komplexy koncové membrány poté migrují za pomoci extranukleárního cytoskeletu, dokud nebyly spárovány odpovídající konce. Poté jsou spojeny intervenující oblasti chromozomu a mohou být spojeny komplexem protein-RNA nazývaným synaptonemální komplex. Autosomy procházejí během meiózy synapse a jsou drženy pohromadě proteinovým komplexem po celé délce chromozomů nazývaných synaptonemální komplex. Pohlavní chromozomy také podléhají synapsi; avšak synaptonemální proteinový komplex, který drží homologní chromozomy pohromadě, je přítomen pouze na jednom konci každého pohlavního chromozomu.
Synapse během meiózy. Zakroužkovaná oblast je část, kde dochází k synapsi, kde se obě chromatidy setkají před přechodem
To by nemělo být zaměňováno s mitózou. Mitóza má také profázu, ale obvykle neprovádí párování dvou homologních chromozomů.
Když se nesesterské chromatidy propletou, segmenty chromatidů s podobnou sekvencí se mohou rozpadnout a vyměnit v procesu známém jako genetická rekombinace nebo „přejezd“. Tato výměna produkuje chiasma, oblast ve tvaru X, kde jsou oba chromozomy fyzicky spojeny. Alespoň jedno chiasma na chromozom se často jeví jako nezbytné ke stabilizaci bivalentů podél metafázové destičky během separace. Crossover genetického materiálu také poskytuje možnou obranu proti mechanismům „zabijáků chromozomů“ odstraněním rozdílu mezi „já“ a „ne-já“, jehož prostřednictvím by takový mechanismus mohl fungovat. Dalším důsledkem rekombinantní synapsy je zvýšení genetické variability u potomků. Opakovaná rekombinace má také obecný účinek spočívající v tom, že umožňuje generacím pohybovat se geny nezávisle na sobě, což umožňuje nezávislou koncentraci prospěšných genů a čištění škodlivých.
Po synapse se odkazuje na typ rekombinace k tomu, jak se často vyskytuje žíhání řetězce závislé na syntéze (SDSA). SDSA rekombinace zahrnuje výměnu informací mezi spárovanými nesesterskými homologními chromatidy, ale ne fyzickou výměnu. Rekombinace SDSA nezpůsobuje křížení. Non-crossover i crossover typy rekombinace fungují jako procesy pro opravu poškození DNA, zejména dvouřetězcových zlomů (viz Genetická rekombinace).
Ústřední funkcí synapsy je tedy identifikace homologů párováním, základní krok pro úspěšnou meiózu. Procesy opravy DNA a tvorby chiasmat, které probíhají po synapse, mají důsledky na mnoha úrovních, od buněčného přežití až po dopady na samotnou evoluci.